在内蒙古自治区 118.3万平方公里的地域内,分布着自治区9个民航运输机场：呼和浩特、包头、海拉尔、锡林浩特、赤峰、通辽、乌兰浩特、满洲里和乌海机场。其中,呼和浩特白塔机场飞行区等级为4D级,包头和海拉尔为4C级,其它机场为3C级。目前,阿尔山、二连浩特、鄂尔多斯机场建设的前期准备工作正在进行中,预计“十一五”期间投入使用。届时,自治区内民航运输机场将达到12个。

内蒙古自治区境内的铁路线路由铁道部下属的三个铁路局管辖
　　1、哈尔滨铁路局管辖部分：呼伦贝尔市全境。
　　铁路线路：干线2条：滨洲线(哈尔滨—满洲里)、牙林线(牙克石—满归)。
　　支线5条：博林线(博克图—塔尔气)、伊加线(伊图里河—加格达奇)、伊敏线(海拉尔东—伊敏)、朝乌线(朝中—莫尔道嘎)、卓江联络线(牙克石—汇流河)。
　　铁路单位：哈尔滨铁路局海拉尔铁路办事处
　　2、沈阳铁路局管辖部分：兴安盟全境、通辽市全境、赤峰市南部。
　　铁路线路：干线2条：平齐线(四平—齐齐哈尔)、京通线(北京北—通辽西)。
　　支线4条：大郑线(大虎山—郑家屯)、通让线(通辽东—让湖路)、通霍线(通辽北—霍林河)、通辽南线(通辽—通辽南)。
　　铁路单位：沈阳铁路局通辽铁路办事处
　　3、呼和浩特铁路局管辖部分：内蒙古自治区中西部地区：呼和浩特市、包头市、乌海市、鄂尔多斯市、巴彦淖尔市、乌兰察布市、阿拉善盟、锡林郭勒盟、赤峰市北部。
　　铁路线路：干线4条：京包线(北京北—包头)、包兰线(包头西—兰州东)、集二线(集宁—二连浩特)、集通线(集宁—通辽北)。
　　支线7条(含一条环线)：包白线、包石线、包环线、乌吉线、海公线、郭查线、包神线。